12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1665 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  100 
 
 
570 bp  1130    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1665    100 
 
 
997 bp  1976    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1612    100 
 
 
997 bp  1976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  99.78 
 
 
927 bp  1816    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5434  hypothetical protein  84.16 
 
 
360 bp  131  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.339133 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5831  hypothetical protein  84.16 
 
 
360 bp  131  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.954343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    81.73 
 
 
594 bp  56  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  90.7 
 
 
867 bp  54  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 
849 bp  52  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 
849 bp  52  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  83.15 
 
 
906 bp  52  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0756    90 
 
 
336 bp  48.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.858797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>