25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3183 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  89.52 
 
 		 105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  43.81 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  47.62 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  41.9 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  41.9 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  41.82 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  44.86 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  40.86 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  32.61 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2957  hypothetical protein  32.65 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  31.76 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  35.8 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  35.8 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.12 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  26.04 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>