18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3800 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  68.93 
 
 		 107 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  53.4 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  55.34 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  55.34 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  53.4 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  45.19 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  36.63 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  28.09 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  27.88 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>