19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0402 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  68.93 
 
 
103 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  56.73 
 
 
103 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  56.31 
 
 
102 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  54.37 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  52.43 
 
 
103 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  55.34 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  49.51 
 
 
103 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  49.04 
 
 
104 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  47.12 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  43.69 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  49.52 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  39.13 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  32.29 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  32.61 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2957  hypothetical protein  26.97 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>