18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3488 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  85.29 
 
 		 102 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  81.37 
 
 		 103 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  78.43 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  72.55 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  55.34 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  47.17 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  42.73 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  45.19 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  36.89 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  35.79 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  31.63 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  32.69 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>