172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1269 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1269  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
95 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1430  cell division topological specificity factor MinE  98.95 
 
 
95 aa  185  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  88.78 
 
 
98 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  68.54 
 
 
113 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2883  cell division topological specificity factor MinE  60.76 
 
 
94 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
87 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3687  cell division topological specificity factor MinE  55.42 
 
 
94 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54305  hitchhiker  0.000223876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  59.76 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2972  cell division topological specificity factor MinE  51.61 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1990  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  51.22 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0967  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  53.66 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  56.79 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  46.84 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5495  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0287  cell division topological specificity factor MinE  48.1 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  40.96 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  41.77 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  42.17 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  39.76 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  42.17 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  46.38 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  39.29 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  41.98 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  37.35 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  39.76 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  42.86 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  36.14 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  39.51 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  39.51 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  39.51 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  42.86 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  39.29 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  34.07 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  36.59 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  34.57 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  32.53 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  38.82 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  36.9 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  35.29 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000703577  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000226469  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000014177  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  38.27 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>