100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5495 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5495  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
89 aa  173  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0287  cell division topological specificity factor MinE  75.28 
 
 
89 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3687  cell division topological specificity factor MinE  57.14 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54305  hitchhiker  0.000223876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2883  cell division topological specificity factor MinE  52.33 
 
 
94 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  56.96 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  52.38 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  54.43 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1990  cell division topological specificity factor MinE  55.41 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  52.38 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  49.37 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2972  cell division topological specificity factor MinE  49.37 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  52.78 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  52.78 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1269  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1430  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  49.37 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  41.77 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  50.67 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0967  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  41.98 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  38.89 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  38.89 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  31.51 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  32.88 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  28.95 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  31.17 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  34.67 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0596  cell division topological specificity factor MinE  32.43 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.926303  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  31.08 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  31.08 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0678  cell division topological specificity factor MinE  32.43 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  31.58 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  31.65 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04465  cell division topological specificity factor MinE  29.73 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  30.67 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  28 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1094  cell division topological specificity factor MinE  29.73 
 
 
86 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  32.89 
 
 
94 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  28.05 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  27.03 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  29.73 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  28.05 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  30.12 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  26.83 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  28.77 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  27.03 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  25.68 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  25.68 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395345  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  28.95 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000676449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000738777  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000349629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  27.4 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  27.4 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  28.95 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  27.4 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  26.92 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  28 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  28.38 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  27.78 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  28.21 
 
 
89 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  29.33 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  26.39 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000142715  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  26.39 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  26.39 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  26.92 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2352  cell division topological specificity factor MinE  26.98 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0614704  normal  0.0900841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  26.39 
 
 
89 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000733452  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>