179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4711 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  47.56 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  45.35 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  45.35 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  44.44 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  45.68 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  48.65 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  48.65 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  49.4 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  49.33 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  51.85 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  50 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  48.78 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  50.67 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  50.67 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  46.91 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  46.91 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  50.62 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  48.65 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2972  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1094  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  53.42 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  50.62 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  49.38 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  46.75 
 
 
86 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  51.95 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  51.95 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  46.05 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  46.15 
 
 
86 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  44.44 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  46.34 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  43.75 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  48.61 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  45.68 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  49.32 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  46.58 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1990  cell division topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  45.45 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395345  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  48.65 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  49.32 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000349629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  52.86 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0596  cell division topological specificity factor MinE  45.68 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.926303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  48 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04465  cell division topological specificity factor MinE  44.87 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  46.25 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  46.67 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  47.3 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  44 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000625931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000738777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000676449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  48.65 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  44.59 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  46.75 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  44 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  48.15 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  45 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>