176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0062 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  98.8 
 
 
84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  89.16 
 
 
84 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  87.95 
 
 
84 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  87.95 
 
 
84 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  89.16 
 
 
84 aa  146  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  89.16 
 
 
84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  86.75 
 
 
84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  86.75 
 
 
84 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  86.75 
 
 
84 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  86.75 
 
 
84 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  85.54 
 
 
84 aa  140  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  84.15 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  80.95 
 
 
88 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  80.95 
 
 
88 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  74.12 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  74.07 
 
 
86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  77.11 
 
 
87 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  77.38 
 
 
88 aa  123  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  73.81 
 
 
88 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  74.7 
 
 
87 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  69.51 
 
 
86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  71.76 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  62.65 
 
 
85 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2034  cell division topological specificity factor MinE  59.04 
 
 
86 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  62.65 
 
 
84 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  55.42 
 
 
84 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  56.63 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  56.63 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  55.42 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  48.78 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  48.78 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000733452  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000142715  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
86 aa  77  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000703577  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000226469  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000014177  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1079  cell division topological specificity factor MinE  43.18 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000131881  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  47.22 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  37.8 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0596  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.926303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0678  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  42.17 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04465  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  42.86 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  51.43 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  41.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>