177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4342 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 		 87 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  73.56 
 
 		 87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2972  cell division topological specificity factor MinE  76.4 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  71.26 
 
 		 86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  77.38 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  77.38 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  70.11 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  66.67 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  68.97 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3687  cell division topological specificity factor MinE  64.2 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54305  hitchhiker  0.000223876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2883  cell division topological specificity factor MinE  62.03 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1990  cell division topological specificity factor MinE  62.79 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  62.2 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0967  cell division topological specificity factor MinE  62.65 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1269  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1430  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  59.26 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  54.43 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  57.65 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5495  cell division topological specificity factor MinE  49.37 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0287  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  43.75 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  42.17 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  43.37 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  35.8 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  40.74 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  43.9 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  41.98 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  41.98 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  43.21 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  37.36 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  38.82 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  40.96 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  38.1 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  39.76 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  34.88 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  37.5 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  37.8 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  36.49 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  40.96 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  37.04 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  36.59 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  38.36 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  34.94 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  38.46 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  37.35 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  42.68 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1094  cell division topological specificity factor MinE  36.25 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  36.36 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  32.93 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  38.46 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  39.29 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  32.56 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  36.59 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03461  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0326  cell division topological specificity factor MinE  41.46 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  33.75 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>