208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1267 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1267  septum formation inhibitor  100 
 
 
212 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5381  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1428  septum formation inhibitor  98.58 
 
 
212 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1217  septum formation inhibitor  95.28 
 
 
212 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3375  septum formation inhibitor  70.28 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.789938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0285  septum site-determining protein MinC  61.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5493  septum site-determining protein MinC  52.92 
 
 
265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  52.49 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  50.46 
 
 
239 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  50.69 
 
 
240 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  50.22 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  48.26 
 
 
262 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  47.86 
 
 
253 aa  185  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3508  septum formation inhibitor  45.97 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0612972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1704  septum site-determining protein MinC  48.02 
 
 
244 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1424  septum formation inhibitor  49.12 
 
 
242 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  47.49 
 
 
242 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1263  septum formation inhibitor  48.47 
 
 
245 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.621353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  46.98 
 
 
231 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  47.83 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2881  septum formation inhibitor  53.46 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1213  septum formation inhibitor  45.53 
 
 
249 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3689  septum formation inhibitor  51.36 
 
 
238 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000254308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  41.53 
 
 
282 aa  160  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  44.29 
 
 
237 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  36.12 
 
 
248 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  50.45 
 
 
262 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  37.19 
 
 
238 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  36.23 
 
 
238 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  35.48 
 
 
243 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  47.17 
 
 
241 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  34.35 
 
 
259 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  33.82 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  33.17 
 
 
261 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  50.62 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  42.59 
 
 
284 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  42.59 
 
 
282 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  29.41 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  39.75 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  45.54 
 
 
282 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  47.96 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  32.83 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  46.88 
 
 
271 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  28.04 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  43.64 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  45.19 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  28.5 
 
 
255 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  30.98 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  31.72 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  28.5 
 
 
255 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  29.76 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  30.21 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  30.21 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  45.83 
 
 
270 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  45.36 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  31.72 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  31.72 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  30.21 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  45.83 
 
 
270 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  45.83 
 
 
270 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  47.96 
 
 
256 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  30.21 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  31.71 
 
 
240 aa  85.5  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  32.53 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  43.14 
 
 
244 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  46.94 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  46.94 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  47.92 
 
 
254 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  46.94 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  32.53 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  35.1 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  44.34 
 
 
227 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  44.23 
 
 
275 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  44.34 
 
 
243 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  44.79 
 
 
270 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  46.94 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  44.23 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  39.64 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  44.79 
 
 
270 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  44.79 
 
 
270 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  44.79 
 
 
270 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  34.13 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  33.79 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  44.23 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  41.09 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  45.74 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  33.51 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  35.2 
 
 
256 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  33.33 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  31.9 
 
 
263 aa  82  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  33.14 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  31.61 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  41.9 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  36.26 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  42.59 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  32.08 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  38.76 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  32.08 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  50 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  30.1 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0655  septum site-determining protein MinC  38.14 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>