196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0032 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  58.17 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  54.02 
 
 
255 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  54.02 
 
 
255 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  51.94 
 
 
256 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  52.78 
 
 
251 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  52.87 
 
 
257 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  51.69 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  49.25 
 
 
265 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  50.57 
 
 
271 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  49.2 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  43.51 
 
 
261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  43.51 
 
 
261 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  43.51 
 
 
261 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  40.8 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  41.82 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  43.8 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  43.08 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  42.37 
 
 
257 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  44.66 
 
 
257 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  43.84 
 
 
282 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  39.22 
 
 
284 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  38.89 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  38.97 
 
 
270 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  66.67 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  38.65 
 
 
282 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  40.88 
 
 
267 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  37.2 
 
 
227 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  40.22 
 
 
264 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  68.52 
 
 
278 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  35.43 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  35.04 
 
 
236 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  37.55 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  39.22 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3364  septum formation inhibitor  40.55 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  38.96 
 
 
240 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  38.06 
 
 
238 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  35.74 
 
 
246 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  34.1 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2036  septum site-determining protein MinC  37.94 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  36.99 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  35.29 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  35.71 
 
 
221 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  35.86 
 
 
221 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  61.68 
 
 
277 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  35.86 
 
 
221 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  35.2 
 
 
221 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  35.86 
 
 
221 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  35.86 
 
 
221 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  34.36 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  36.58 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  36.76 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  34.8 
 
 
221 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  34.8 
 
 
221 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  36.72 
 
 
257 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2302  septum site-determining protein MinC  62.96 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  35.46 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  36.44 
 
 
227 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  36.4 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  35.57 
 
 
224 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  36.36 
 
 
249 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  34.92 
 
 
221 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  35.46 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  36 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  36.76 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  33.2 
 
 
221 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  36.4 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  40.31 
 
 
242 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  36.18 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  36 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  36.4 
 
 
255 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  36.32 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  35.43 
 
 
221 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  35.08 
 
 
242 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  33.46 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  33.46 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  33.46 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  33.46 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  32.95 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  36.19 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  34.41 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  36.77 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  32.79 
 
 
232 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  32.27 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  34.08 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  36.07 
 
 
237 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  30.47 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  30.47 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  30.47 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  33.48 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  33.63 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  31.84 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  31.87 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  31.76 
 
 
235 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  31.76 
 
 
235 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>