210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3508 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3508  septum formation inhibitor  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0612972  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  67.17 
 
 		 239 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  65.66 
 
 		 240 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  64.53 
 
 		 262 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  55.64 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  58.27 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  54.34 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1704  septum site-determining protein MinC  50.97 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  46.01 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  44.62 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  46.59 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1424  septum formation inhibitor  46.88 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1263  septum formation inhibitor  45.91 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.621353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2881  septum formation inhibitor  49.8 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1213  septum formation inhibitor  45.31 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0285  septum site-determining protein MinC  42.58 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3689  septum formation inhibitor  48.24 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000254308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  43.85 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  44.11 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5493  septum site-determining protein MinC  39.5 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3375  septum formation inhibitor  43.43 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.789938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1217  septum formation inhibitor  45.08 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1428  septum formation inhibitor  45.08 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1267  septum formation inhibitor  45.49 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  34.1 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  58.95 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  58.95 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  59.18 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  60 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  50.93 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  50.93 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  46.03 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  35.25 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  28.19 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  30.86 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  30.86 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  30.86 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  34.36 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  29.74 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  29.74 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  33.9 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  29.73 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  31.4 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  31.03 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  31.65 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  50.46 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  49.49 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  33.33 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  50 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  50 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  50 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  50 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  50 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  49 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  31.23 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  47.41 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  50 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  30.2 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  47.41 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  47.41 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  32.63 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  30.47 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  46.55 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  46.55 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  46.55 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  46.55 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  50 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  49.49 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  26.82 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  32.2 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  47.62 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  30.5 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  28.19 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  30.99 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  28.57 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  46.67 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  31.02 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  28.52 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  28.52 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  28.52 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  28.52 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  28.52 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  40.98 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  30.49 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  48.96 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  44.44 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  46.67 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>