206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1263 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1263  septum formation inhibitor  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.621353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1424  septum formation inhibitor  98.35 
 
 
242 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1213  septum formation inhibitor  85.94 
 
 
249 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  60.59 
 
 
247 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  50.2 
 
 
262 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  51.68 
 
 
240 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  51.45 
 
 
268 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  51.64 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  53.36 
 
 
239 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  51.03 
 
 
247 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  49.8 
 
 
242 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3508  septum formation inhibitor  46.69 
 
 
266 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0612972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2881  septum formation inhibitor  57.92 
 
 
235 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0285  septum site-determining protein MinC  50 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1704  septum site-determining protein MinC  48.37 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  45.9 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3689  septum formation inhibitor  54.58 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000254308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3375  septum formation inhibitor  46.84 
 
 
242 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.789938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5493  septum site-determining protein MinC  44.24 
 
 
265 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1217  septum formation inhibitor  48.03 
 
 
212 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1428  septum formation inhibitor  48.47 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  45.38 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1267  septum formation inhibitor  48.03 
 
 
212 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5381  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  43.44 
 
 
282 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  36.36 
 
 
248 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  32.78 
 
 
221 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  32.38 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  32.38 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  32.37 
 
 
221 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  31.67 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  31.67 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  31.67 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  31.67 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  36.21 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  32.37 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  34.82 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  32.35 
 
 
243 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  30.61 
 
 
228 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  34.58 
 
 
236 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  33.33 
 
 
221 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  56 
 
 
262 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  34.58 
 
 
227 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  31.98 
 
 
235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  31.98 
 
 
235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  31.3 
 
 
221 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  46.51 
 
 
270 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  31.98 
 
 
235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  31.98 
 
 
235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  46.51 
 
 
270 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  46.51 
 
 
270 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  31.98 
 
 
235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  31.12 
 
 
221 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  56 
 
 
243 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  32.13 
 
 
241 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  32.93 
 
 
240 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  45.74 
 
 
270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  29.55 
 
 
236 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  29.55 
 
 
236 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  45.74 
 
 
270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  45.74 
 
 
270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  45.74 
 
 
270 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  46.55 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  34.31 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  34.31 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  32.93 
 
 
235 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  32.09 
 
 
233 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  45.71 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  33.18 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  33.61 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  31.25 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  48.15 
 
 
257 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  33.64 
 
 
263 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  47.66 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  49.53 
 
 
251 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  29.96 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  31.15 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  31.15 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  31.15 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  31.25 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  31.15 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  31.15 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  50 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  46.73 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  45.45 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  46.73 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  50 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  27.08 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  43.29 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  45.07 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  44.44 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  48.6 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  46.67 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  32.7 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  33.46 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  44.64 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  31.44 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  46.79 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  46.3 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  46.79 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  32.33 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>