212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3237 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  96.25 
 
 		 264 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3364  septum formation inhibitor  81.27 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  56.14 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  57.3 
 
 		 270 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  56.57 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  56.57 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  56.57 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  56.57 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  55.4 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  53.85 
 
 		 284 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  56.83 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  51.24 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  54.14 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  54.31 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  54.31 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  55.06 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  51.59 
 
 		 282 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  51.88 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  52.26 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  53.01 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  43.49 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  43.49 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  43.02 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  41.89 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  44.57 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  40.89 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  40.88 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  66.97 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  41 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  42.53 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  61.11 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  34.35 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  37.02 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  36.47 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  35.09 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2302  septum site-determining protein MinC  38.17 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  37.04 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  36.68 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  35.91 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  34.81 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  36.64 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2036  septum site-determining protein MinC  37.64 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  36.86 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  34.73 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  33.97 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  35.97 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  49.23 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  32.82 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  32.82 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  32.82 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  32.82 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  32.82 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  33.85 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  50.47 
 
 		 236 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  49.53 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  46.92 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  31.8 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  50 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  31.89 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  53.27 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  32.43 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  33.85 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  32.57 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  31.8 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  47.9 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  47.9 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  47.9 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  31.56 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  31.56 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  31.56 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  31.56 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  31.56 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  30.27 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  32.68 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  35.95 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  33.46 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  33.08 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  33.08 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  49.07 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  49.07 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  49.07 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  49.07 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  32.68 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  32.31 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  30.42 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  27.48 
 
 		 221 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  29.84 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  48.6 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  29.43 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  31.08 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  28.08 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  29.84 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  35.96 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  35.93 
 
 		 242 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>