15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5602 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5602  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2729  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  28.86 
 
 		 303 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2602  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  28.86 
 
 		 303 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0111  putative type IV secretion system protein DotC  27.1 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.200917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0351  DotC  28.4 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1832  DotC protein  28.4 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3447  hypothetical protein  28.92 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0102  lipoprotein  28.09 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.191153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0051  traI protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0044  relaxase  25.93 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4280  hypothetical protein  23.5 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3678  DotC  28.81 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  56.52 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15910  hypothetical protein  57.89 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  61.11 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>