12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0111 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0111  putative type IV secretion system protein DotC  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.200917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2729  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  36.18 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2602  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  36.18 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0351  DotC  32.75 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1832  DotC protein  32.31 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3447  hypothetical protein  34.29 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0102  lipoprotein  26.67 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.191153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3678  DotC  27.11 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0051  traI protein  28.78 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0044  relaxase  28.78 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4280  hypothetical protein  27.81 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5602  hypothetical protein  27.1 
 
 		 384 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.0253626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>