12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0102 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0102  lipoprotein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.191153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0051  traI protein  55.68 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0044  relaxase  55.68 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1832  DotC protein  33.21 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0351  DotC  33.21 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2729  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  28.51 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2602  defect in organelle trafficking lipoprotein DotC  28.51 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0111  putative type IV secretion system protein DotC  26.67 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.200917  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3678  DotC  28.52 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4280  hypothetical protein  28.91 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3447  hypothetical protein  30.52 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5602  hypothetical protein  28.09 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.0253626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>