16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0025 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  91.07 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  87.69 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  89.29 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  86.76 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  87.72 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  89.8 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  87.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 
85 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>