More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3651 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3651  HesB protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233202  normal  0.170589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1787  HesB/YadR/YfhF  55.79 
 
 
107 aa  116  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.52 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.52 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.51 
 
 
124 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.49 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.49 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
124 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.47 
 
 
116 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
124 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.48 
 
 
122 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.48 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  44.12 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.48 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.16 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.16 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  46.08 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.12 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
121 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  42.16 
 
 
113 aa  90.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
113 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  40.2 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.2 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.2 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.2 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  41.18 
 
 
113 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.2 
 
 
114 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  43.43 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  42.16 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.16 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  42.42 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.43 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0502  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
105 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.42 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.42 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>