25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1988 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  93.49 
 
 		 228 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  25.85 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  27.11 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  25.16 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 628 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 370 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 		 692 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  24.14 
 
 		 350 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  23.96 
 
 		 687 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2371  hypothetical protein  25.9 
 
 		 349 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  23.45 
 
 		 350 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  23.45 
 
 		 350 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2522  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683526  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4318  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2218  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2114  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1990  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.106664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1865  ISPpu8, transposase  28.03 
 
 		 433 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  23.45 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  23.45 
 
 		 363 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  24.69 
 
 		 558 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 		 350 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 		 363 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 		 363 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>