11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2371 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2371  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  721    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  24.79 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0161  hypothetical protein  21.7 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0458  hypothetical protein  21.89 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0417  hypothetical protein  21.03 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0638  transposase  21.98 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0795  transposase  21.98 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  20.54 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  27.33 
 
 
228 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  22.27 
 
 
558 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  25.9 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>