31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2942 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  100 
 
 
558 aa  1157    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  32.06 
 
 
687 aa  217  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  31.08 
 
 
692 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  35.28 
 
 
628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  24.4 
 
 
369 aa  108  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  24.87 
 
 
584 aa  106  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3154  hypothetical protein  27.06 
 
 
322 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3440  hypothetical protein  26.52 
 
 
311 aa  90.5  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  24.38 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1891  hypothetical protein  38.14 
 
 
135 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092595 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0458  hypothetical protein  21.89 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0638  transposase  23.93 
 
 
374 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0795  transposase  23.93 
 
 
374 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0417  hypothetical protein  21.03 
 
 
363 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  25.54 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2371  hypothetical protein  22.63 
 
 
349 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 
364 aa  50.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 
364 aa  50.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0054  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00175854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1024  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.765298  normal  0.715821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1606  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1840  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156024  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3439  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2857  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0161  hypothetical protein  23.14 
 
 
331 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  21.5 
 
 
228 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0893  hypothetical protein  19.41 
 
 
332 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>