14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1773 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1773  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.659619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1772  PQQ repeat-containing protein  31.32 
 
 		 572 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0986  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1864  Tup1 like transcriptional repressor  21.88 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.255224 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3468  Tup1 like transcriptional repressor  22.51 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  24.35 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.58 
 
 		 1194 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1552 aa  47  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  28 
 
 		 574 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  30.1 
 
 		 960 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0887  hypothetical protein  28.22 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.25 
 
 		 947 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  24.52 
 
 		 629 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 696 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>