23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1449 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000162485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1535  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  61.32 
 
 
290 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.484969  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0811  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.98 
 
 
290 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1140  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.98 
 
 
290 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0241671  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1146  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  61.32 
 
 
309 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  58.62 
 
 
676 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  48.65 
 
 
845 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  42.31 
 
 
843 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  42.31 
 
 
827 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  38.1 
 
 
935 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 
708 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0695  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 
678 aa  45.1  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  41.86 
 
 
859 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 
693 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  40.91 
 
 
684 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  39.62 
 
 
841 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  32.88 
 
 
855 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 
765 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  45.95 
 
 
694 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 
765 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 
836 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00026  putative DNA topoisomerase; C4 zinc finger domain protein  37.25 
 
 
180 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.979769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  43.9 
 
 
768 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>