10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02021 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 59 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  45.65 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  47.83 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  44.68 
 
 		 268 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  43.75 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.58 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  47.62 
 
 		 251 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  41.18 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  41.3 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  41.3 
 
 		 264 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>