11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6567 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  53.28 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  53.69 
 
 		 225 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  45.71 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  41.13 
 
 		 268 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.29 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  46.41 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  42.14 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  30.61 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  48.1 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  41.18 
 
 		 59 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>