11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3892 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 284 aa  594  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  65.53 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.87 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  38.77 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  53.85 
 
 		 225 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  52.12 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  39.2 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  36.72 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  37.4 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  34.95 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  45.65 
 
 		 59 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>