11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7399 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 251 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.09 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  37.4 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  31.99 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  43.95 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  36.63 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  38.93 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  29.83 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  29.24 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  47.62 
 
 		 59 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>