11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2747 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 268 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  66.41 
 
 		 284 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.26 
 
 		 306 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.19 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  41.27 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  38.85 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  39.11 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  36.8 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.09 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  34.24 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  44.68 
 
 		 59 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>