More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0551 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0551  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3560  (2Fe-2S)-binding domain protein  76.25 
 
 
170 aa  244  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300531  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2021  (2Fe-2S)-binding domain protein  72.73 
 
 
176 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1452  (2Fe-2S)-binding domain protein  72.33 
 
 
167 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1290  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.33 
 
 
167 aa  234  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.482745  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5855  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.03 
 
 
175 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3731  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  67.88 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2175  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.06 
 
 
161 aa  187  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4201  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
166 aa  184  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.998013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.33 
 
 
168 aa  173  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.69 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  56.69 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.69 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.36 
 
 
163 aa  168  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.2 
 
 
164 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  49.38 
 
 
164 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.98 
 
 
165 aa  167  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  53.59 
 
 
165 aa  167  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2948  (2Fe-2S)-binding  54.61 
 
 
157 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.62 
 
 
166 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4710  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.04 
 
 
165 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729129  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  55.03 
 
 
191 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6671  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.55 
 
 
178 aa  163  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118313  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.77 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.85 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.64 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  55.1 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.3 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  52.41 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.67 
 
 
160 aa  160  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.25 
 
 
191 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.32 
 
 
160 aa  158  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2075  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  51.88 
 
 
176 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8052  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0075  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  55.1 
 
 
167 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1746  (2Fe-2S)-binding domain protein  54 
 
 
191 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.99 
 
 
175 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.67 
 
 
400 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.94 
 
 
171 aa  157  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0095  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.37 
 
 
163 aa  157  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  52.98 
 
 
161 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.72 
 
 
175 aa  156  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  47.4 
 
 
162 aa  156  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  50.97 
 
 
190 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0111  (2Fe-2S)-binding protein  50.99 
 
 
161 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.72 
 
 
160 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  52.87 
 
 
156 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1220  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  53.38 
 
 
165 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.01 
 
 
185 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  52.98 
 
 
161 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
167 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4326  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.64 
 
 
161 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.1 
 
 
170 aa  154  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.59 
 
 
173 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.35 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0850  (2Fe-2S)-binding  55.63 
 
 
173 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  51.02 
 
 
175 aa  153  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
154 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4351  putative carbon-monoxide dehydrogenase, small subunit (CoxS)  48.05 
 
 
176 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4234  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.28 
 
 
173 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4925  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.67 
 
 
178 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 
158 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1782  (2Fe-2S)-binding  52.98 
 
 
165 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.97 
 
 
181 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.69 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1748  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  49.31 
 
 
166 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0965  (2Fe-2S)-binding protein  49.38 
 
 
165 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  52.98 
 
 
165 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.37 
 
 
165 aa  151  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.68 
 
 
405 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.94 
 
 
168 aa  151  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.97 
 
 
172 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0595  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
168 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.25 
 
 
399 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.02 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.45 
 
 
170 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2607  (2Fe-2S)-binding  51.66 
 
 
161 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  51.39 
 
 
161 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
191 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.44 
 
 
215 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5356  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.97 
 
 
162 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5441  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.24 
 
 
166 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3721  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.68 
 
 
169 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402423  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.3 
 
 
163 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13110  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS-like protein  46.45 
 
 
181 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.73 
 
 
162 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  45.57 
 
 
161 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  51.39 
 
 
162 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3970  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.02 
 
 
156 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0370  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.75 
 
 
172 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  49.32 
 
 
161 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  51.75 
 
 
161 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4148  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
157 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.971247  hitchhiker  0.0010225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0425  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  48.48 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.56858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  48.32 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.67 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.64 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>