38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A07 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A07  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  310  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.201977  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2558  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.86 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  28.44 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  48.1 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  53.03 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  51.67 
 
 
280 aa  70.5  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  48.39 
 
 
274 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  50.85 
 
 
250 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  50.85 
 
 
250 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  33.76 
 
 
280 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.07 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  42.11 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  34.43 
 
 
245 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.79 
 
 
265 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  34.15 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  29.51 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  33.8 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  35 
 
 
371 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  42.86 
 
 
242 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 
372 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 
372 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  33.33 
 
 
372 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.38 
 
 
235 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  36.51 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  37.93 
 
 
368 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  33.85 
 
 
229 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  32.31 
 
 
239 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  41.07 
 
 
249 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  33.85 
 
 
244 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  33.85 
 
 
245 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  33.85 
 
 
245 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  33.85 
 
 
245 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  41.07 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.7 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.48 
 
 
396 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  32.89 
 
 
387 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>