16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0871 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0871  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1706  hypothetical protein  31.22 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0492  hypothetical protein  31.1 
 
 
247 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0144  hypothetical protein  32.35 
 
 
227 aa  104  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.322156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0602  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00353169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1537  hypothetical protein  31.77 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.488213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1528  hypothetical protein  28.99 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1588  hypothetical protein  26.26 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  26.13 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  25.5 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  25.49 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  24.63 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  23.84 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  24.04 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  27.07 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>