12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  88.32 
 
 		 489 aa  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  949    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0820  hypothetical protein  53.33 
 
 		 418 aa  317  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0442  hypothetical protein  29.72 
 
 		 485 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  27.78 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  25.09 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  25.47 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8296  integral membrane protein  25.17 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  24.47 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1570  hypothetical protein  26.04 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3324  hypothetical protein  25.4 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108398  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 2570 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>