18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5433 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  44 
 
 
523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  34.27 
 
 
330 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  26.1 
 
 
479 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  24.04 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  24.38 
 
 
495 aa  66.6  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  24.2 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0820  hypothetical protein  27.31 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4713  hypothetical protein  23.15 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.356808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1570  hypothetical protein  26 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4213  hypothetical protein  35.14 
 
 
353 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2241  hypothetical protein  28.41 
 
 
656 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4557  hypothetical protein  26.09 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0932353 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4279  hypothetical protein  26.94 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8296  integral membrane protein  23.46 
 
 
457 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4504  hypothetical protein  34.65 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1339  hypothetical protein  25.42 
 
 
570 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4865  hypothetical protein  24.44 
 
 
587 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>