13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0036 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  895    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  64.14 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  26.57 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0820  hypothetical protein  29.54 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  27.66 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  27.72 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3324  hypothetical protein  25 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108398  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0442  hypothetical protein  27.39 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  24.67 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4713  hypothetical protein  23.33 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.356808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8296  integral membrane protein  25 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1570  hypothetical protein  25.17 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0685  hypothetical protein  28.68 
 
 		 540 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.771195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>