13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7296 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  925    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  63.75 
 
 
460 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0820  hypothetical protein  28.36 
 
 
418 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  25.09 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  25.78 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0442  hypothetical protein  24.72 
 
 
485 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  26.33 
 
 
483 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3324  hypothetical protein  23.35 
 
 
511 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108398  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  26.96 
 
 
523 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4713  hypothetical protein  24.17 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.356808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1339  hypothetical protein  21.43 
 
 
570 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1570  hypothetical protein  26.87 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8296  integral membrane protein  24.79 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>