10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3324 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  952    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108398  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1339  hypothetical protein  44.75 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.76 
 
 		 2914 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.5 
 
 		 2851 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  23.35 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  23.95 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  29.63 
 
 		 523 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  28.71 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  47.95 
 
 		 1426 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>