42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3668 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3668  Glycosyltransferase 28 domain  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0732  Glycosyltransferase 28 domain protein  41 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5299  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  41.22 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5181  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  36.84 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1151  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695436  hitchhiker  0.0000000000708662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3972  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  37.68 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0465907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4576  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  32.52 
 
 		 146 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1840  glycosyltransferase family 28 protein  36 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1065  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase  32.8 
 
 		 158 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1831  glycosyltransferase family 28 protein  35.71 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.627696  hitchhiker  0.00418899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5182  Glycosyltransferase 28 domain protein  34.62 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1359  glycosyltransferase 28-like protein  28.99 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1170  polysaccharide biosynthesis protein CpsF  31.15 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1152  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase  30.4 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000725593  hitchhiker  0.00000000000139047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2689  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  34.68 
 
 		 151 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.174282  normal  0.224613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02731  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  25.95 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1830  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14-like protein  44.17 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00817863  normal  0.0121958 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1169  glycosyl transferase CpsG(V)  29.41 
 
 		 163 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5300  D-glucuronyl C5-epimerase domain protein  36.07 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1064  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0959  glycosyltransferase family 28 protein  31.3 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0925107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2690  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.93 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64917  normal  0.15136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1203  glycosyltransferase family 28 protein  29.63 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1564  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  25.32 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2975  Glycosyltransferase 28 domain  31.34 
 
 		 158 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27911  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  26.19 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3223  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.4 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02151  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  24.92 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4577  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.89 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1839  oligosaccharide biosynthesis Alg14-like protein  40 
 
 		 160 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2147  N-acetylglucosaminyltransferase, MurG  27.15 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1042  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.68 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0819675  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5095  glycosyltransferase family 28 protein  30.17 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0741  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.14 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2095  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  24.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2977  hypothetical protein  26.39 
 
 		 160 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1676  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  24.44 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0743  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3601  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  25.78 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0055  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.88 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2110  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.13 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>