29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1170 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1170  polysaccharide biosynthesis protein CpsF  100 
 
 		 149 aa  307  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1152  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase  81.21 
 
 		 149 aa  258  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000725593  hitchhiker  0.00000000000139047 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1065  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase  73.83 
 
 		 158 aa  243  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3972  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  48.98 
 
 		 152 aa  153  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0465907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4576  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  47.18 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2689  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  46.48 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.174282  normal  0.224613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1830  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14-like protein  48.3 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00817863  normal  0.0121958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1839  oligosaccharide biosynthesis Alg14-like protein  49.66 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5299  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  42.57 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5096  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like  40.94 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5181  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  37.76 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1202  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14-like protein  37.75 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1360  polysaccharide biosynthesis protein CpsF  35.81 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0732  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.58 
 
 		 332 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4133  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14-like protein  28.37 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3668  Glycosyltransferase 28 domain  31.15 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3222  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like protein  28.17 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2974  Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like  28.06 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0421  hypothetical protein  28.8 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0958  oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like  24.82 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0180349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14444  udp-n-acetylglucosamine n-acetylglucosaminyltransferase  31.31 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32391  predicted protein  37.23 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2977  hypothetical protein  33.77 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1277  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  29.33 
 
 		 368 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01840  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.808544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  27.03 
 
 		 352 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43228  predicted protein  30.38 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000182258 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43197  predicted protein  30.38 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024705  normal  0.0274822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1080  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>