22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1840 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1840  glycosyltransferase family 28 protein  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1831  glycosyltransferase family 28 protein  86.73 
 
 		 213 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.627696  hitchhiker  0.00418899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 525 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1169  glycosyl transferase CpsG(V)  36.94 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1151  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695436  hitchhiker  0.0000000000708662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5300  D-glucuronyl C5-epimerase domain protein  40.34 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5182  Glycosyltransferase 28 domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2690  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.21 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64917  normal  0.15136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3668  Glycosyltransferase 28 domain  36 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1064  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4577  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.84 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1359  glycosyltransferase 28-like protein  29.41 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0732  Glycosyltransferase 28 domain protein  35.88 
 
 		 332 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3223  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.15 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2975  Glycosyltransferase 28 domain  29.41 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1203  glycosyltransferase family 28 protein  21.92 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0959  glycosyltransferase family 28 protein  30.77 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0925107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2190  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  37.38 
 
 		 364 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2844  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.43 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3089  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 366 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2724  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 366 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1436  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.78 
 
 		 373 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>