18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1483 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0072  hypothetical protein  62.38 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  51.23 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  52.26 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  52.26 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  52.26 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  51.52 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  49.5 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0197  hypothetical protein  50.47 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  49.75 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  34.18 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  32.95 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  32.37 
 
 		 192 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  31.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  31.4 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  32.18 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>