19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0244 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  53.07 
 
 		 192 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  50.83 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  50.54 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  52.2 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  49.72 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4317  hypothetical protein  46.74 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681233  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08430  hypothetical protein  45.65 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220757  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  44.32 
 
 		 182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  44.75 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  34.69 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  32.37 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0072  hypothetical protein  31.35 
 
 		 268 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  30.22 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  31.14 
 
 		 232 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  31.14 
 
 		 232 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  31.14 
 
 		 232 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  28.27 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>