20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0841 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  77.05 
 
 		 192 aa  289  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  73.51 
 
 		 186 aa  275  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4317  hypothetical protein  69.19 
 
 		 193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681233  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  66.3 
 
 		 187 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08430  hypothetical protein  59.89 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220757  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  58.92 
 
 		 182 aa  207  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  54.3 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  49.72 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  34.48 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  31.61 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  28.93 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  30.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  30.27 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0197  hypothetical protein  29.1 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  30.27 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  30.27 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>