12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  63.19 
 
 
182 aa  246  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08430  hypothetical protein  62.57 
 
 
190 aa  226  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220757  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  58.92 
 
 
197 aa  207  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  56.15 
 
 
186 aa  207  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  58.6 
 
 
192 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  55.38 
 
 
192 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  53.55 
 
 
187 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4317  hypothetical protein  55.91 
 
 
193 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681233  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  44.75 
 
 
189 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  32.18 
 
 
259 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>