20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2050 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  77.08 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  73.91 
 
 
186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  69.19 
 
 
197 aa  268  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  62.98 
 
 
187 aa  245  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4317  hypothetical protein  58.64 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681233  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08430  hypothetical protein  60.75 
 
 
190 aa  224  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220757  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  55.38 
 
 
182 aa  194  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  50.81 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  49.18 
 
 
189 aa  159  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  30.57 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  31.28 
 
 
242 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  29.67 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  29.67 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  29.67 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  30.37 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0197  hypothetical protein  28.27 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513429  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0072  hypothetical protein  27.93 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>