17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0365 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  81.55 
 
 
232 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  81.55 
 
 
232 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  81.55 
 
 
232 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  78.2 
 
 
237 aa  324  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  78.54 
 
 
242 aa  316  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  74.16 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0197  hypothetical protein  79.9 
 
 
239 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513429  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0072  hypothetical protein  51.6 
 
 
268 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  51.52 
 
 
259 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  30.57 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  30.48 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  31.61 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  30.35 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  30.48 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  45.1  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  30.98 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>