21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1619 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1619  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  563  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.631243  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  63.4 
 
 
267 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  62.75 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  37.56 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  42.25 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0868  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  40.43 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  39.22 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  33.83 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  38.69 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  32.41 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  31.72 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  26.42 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  25.62 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0872  hypothetical protein  55.32 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  27.85 
 
 
212 aa  45.4  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  26.47 
 
 
303 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18010  hypothetical protein  32.95 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000611728  normal  0.273057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  27.01 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1756  hypothetical protein  29.57 
 
 
298 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00985833  hitchhiker  0.000872746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>