12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1756 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00985833  hitchhiker  0.000872746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3155  hypothetical protein  66.53 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  33.78 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  32.08 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  35.14 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  32.19 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0809  hypothetical protein  36.27 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615183  normal  0.0293285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  39.71 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  38.24 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  32.43 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>