21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  713    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  39.5 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  39.5 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  38.1 
 
 		 278 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  36.31 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  33.1 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  30.67 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  32.67 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  39.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  40.34 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1619  hypothetical protein  33.83 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  30.46 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  33.8 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  32.19 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0781  hypothetical protein  29.61 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0308662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0868  hypothetical protein  27.54 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18010  hypothetical protein  31.25 
 
 		 99 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000611728  normal  0.273057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3155  hypothetical protein  34.04 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>